Paramédical 36

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Paramédical 36

 

structure du gene

 

Les gènes correspondent à des segments de l’ADN présent dans les chromosomes. Chaque gène est caractérisé par une séquence de nucléotides particulière qui constitue un message codé. La traduction de ce message permet la synthèse d’un polypeptide assurant une fonction cellulaire très précise. Dans l’espèce humaine, on dénombre 30 000 gènes environ.

 

le gene

 

Un gène correspond à un segment de l’un des 2 brins de l’ADN. Ce brin, aussi appelé bin transcrit ou non sens, sert de matrice à l’ARNm qui sera traduit en protéine. Le brin d’ADN complémentaire (= brin non transcrit ou brin sens) est utilisé pour déterminer la séquence de nucléotides de l’ARNm.

Le gène peut être découpé en plusieurs zones :

-          R : les zones régulatrices

Elles contrôlent l’initiation de la transcription et sont situées en amont de la partie transcrite du gène.

-          P : le promoteur

Ce segment d’ADN aussi nommé « Tatabox » permet d’initier la transcription.

-          T : les zones transcrites

Elles sont de 2 types :

§   Les exons, régions codantes de l’ADN

§   Les introns, régions non codantes de l’ADN.

 

genes et nucleotides

 

Les nucléotides qui constituent le gène sont des molécules complexes composées de :

-          un article phosphorique,

-          un sucre (le désoxyribose)

-          une base azotée.

Il existe 4 types de bases dans l’ADN :

A = adénine

T = thymine

C = cytosine

G = guanine.

 

schema

 

Chromosome

Locus

R

P

T

 

AGCA

TCGT

 

ACAG

TGTC

 

CA

GT

 

Brin d’ADN non transcrit = séquence d’ADN codant pour une proteine

 

Promoteur

TATAAAA…

Début de la traduction

ATG GTG CAC CTG ACT CCT GAG GAG AAG TCT GCC GTT ACT GCC CTG TGG GGC AAG GTG AAC TAC CAC GTG GAC TGA GGA CTC CTC TTC AGA CGG CAA TGA CGG GAC ACC CCG TTG TTC CAC TTG ATG GTG CAC CTG ACT CCT GAG GAG AAG TCT GCC GTT ACT GCC CTG TGG GGC AAG GTG AAC…TAA…AATAAA…

Fin de la traduction

 

 

Sens de lecture du gène à zones régulatrices à promoteur à zones transcrites (introns et exons)

 

du gene a la proteine

 

L’expression de l’information génétique, c’est-à-dire le passage du gène à la protéine s’effectue en 2 étapes :

-          La transcription est la copie d’un gène ARNm (1) ; elle se déroule dans le noyau.

-          La traduction est la synthèse d’une protéine à partir de l’ARNm ; elle a lieu dans le cytoplasme au niveau des ribosomes.

La correspondance information génétique (séquence de nucléotides, A-T-C-G) et protéine (séquence d’acides aminés, Aa) s’effectue grâce au code génétique (2).

 

(1)     Acide ribonucléique messager, molécule qui transfère l’information génétique du noyau vers le cytoplasme.

(2)     Code de lecture universel de l’information génétique.

 

transcription

 

1.        Le gène qui code pour la protéine est transcrit en ARN transcrit primaire : ensemble d’introns et d’exons complémentaires du brin d’ADN transcrit. Cette étape est catalysée par différents facteurs de transcription dont la polymérase II qui ouvre l’ADN.

2.        Des enzymes modifient l’ARN :

.               - les introns sont éliminés et les exons fusionnent (épissage)

.               - les extrémités sont recouvertes de séquences protectrices (chaperon et queue poly-A)

3.        L’ARNm passe dans le cytoplasme.

 

SCHEMA :              TRANSCRIPTION DANS LE NOYAU

                              

1.        ADN

                ARN polymérase II

                Brin d’ADN non transcrit

                Gène = brin d’ADN transcrit

2.        ARN transcrit primaire

ARNm

3.        Hors de la cellule : Ribosome

Protéine

ARNm

 

traduction

 

4.        Dans le cytoplasme, les ribosomes (assemblage de 2 sous-unités d’ARNr) progressent le long de l’ARNm en lisant les codons.

5.        Les ARN de transfert (ARNt) transportent les Aa jusqu’au brin d’ARNm.

L’anticodon de l’ARNt reconnaît le codon de l’ARNm. L’Aa transporté se rattache au suivant par une liaison peptidique.

6.        L’ARNt se détache et devient disponible pour un nouveau transport.

Chaque fois que le ribosome avance le long de l’ARNm, un Aa s’ajoute à la chaîne poolypeptidique.

 

SCHEMA :              TRADUCTION DANS LE CYTOPLASME

 

4.        Dans le cytoplasme, les ribosomes progressent le long de l’ARNm en lisant les codons

5.        Aa, ARNt, anticodon, codon, ARNm

Les ARNt transportent l’Aa jusqu’au brin d’ARNm. L’Aa transporté se détache de l’ARNt et s’attache à la protéine par une nouvelle liaison peptidique.

6.        L’ARNt se détache et devient disponible pour un nouveau transport.

 

information genetique

 

Les nucléotides qui constituent les acides nucléiques (ADN et ARN) sont des molécules complexes qui associent un acide phosphorique, un sucre (le désoxyribose dans l’ADN, le ribose dans l’ARN) et une base azotée. Il existe 5 types de bases :

-          A=adénine, T=thymine, C=cytosine, G=guanine dans l’ADN.

-          U=uracile, remplace la thymine dans l’ARN.

L’ordre dans lequel s’enchaînent les nucléotides dans le brin non transcrit de l’ADN détermine la séquence des nucléotides de l’ARNm correspondant.

 

SCHEMA :              INFORMATION GENETIQUE

 

TAC CAC GTG GAC TGA GGA CTC                    I

CTC TTC AGA CGG CAA TGA CGG                    I

GAC ACC CCG TTC CAC TTG…                          I

Gène = brin d’ADN transcrit                                  I

                                                                              I              ADN

ATG GTG CAC CTG ACT CCT GAG                    I

GAG AAG TCT GCC GTT ACT GCC                    I

CTG TGG GGC AAG GTG AAC…                        I

Brin d’ADN non transcrit                                       I

 

AUG GUG CAC CUG ACU CCU GAG

GAG AAG UCU GCC GUU ACU GCC

CUG UGG GGC AAG GUG AAC…                                      ARNm

 

Met Val His Leu Thr Pro Glu Glu

Lys Ser Ala Val Thr Ala Leu Trp

Gly Lys Val Asn…                                                                Polypeptide

 

Code genetique

 

Le code génétique établit une correspondance entre l’ARNm (issu de l’ADN) et les acides aminés (Aa) qui composent les protéines : à chaque ensemble de 3 bases azotées (codon) de l’ARNm correspond un Aa. La séquence des bases commande donc la séquence des Aa d’une protéine.

Il existe 64 combinaisons possibles de 3 bases, soit 64 codons différents pour seulement 20 Aa. A un codon correspond toujours le même Aa et plusieurs codons donnent le même Aa. Le code génétique est redondant, continu et non chevauchant.

 

SCHEMA :              CODE GENETIQUE

 

PREMIERE BASE                  DEUXIEME BASE                 TROISIEME BASE

U                                            U                                            UCAG

C                                             C                                             UCAG

A                                            A                                            UCAG

G                                            G                                            UCAG

 

UUU        I              Phe          UCU        I                              UAU        I              Tyr          UGU        I              Cys

UUC        I                              UCC        I                              UAC        I                              UGC        I             

                                                               I              Ser

UUA        I              Leu          UCA        I                              UAA        Arrêt                       UGA        Arrêt

UUG        I                              UCG        I                              UAG        Arrêt                       UGG                       Trp

 

CUU        I                              CCU        I                              CAU        I              His          CGU        I             

CUC        I                              CCC         I                              CAC        I                              CGC        I
                I              Leu                         I              Pro                                                                         I              Arg

CUA        I                              CCA        I                              CAA        I              Gln          CGA        I

CUG        I                              CCG        I                              CAG        I                              CGG        I

 

AUU        I                              ACU        I                              AAU        I              Asn         AGU        I              Ser

AUC        I              Ile            ACC        I                              AAC        I                              AGC        I

AUA        I                                              I              Thr

                                               ACA        I                              AAA        I              Lys          AGA        I              Arg

AUG        I              Met          ACG        I                              AAG        I                              AGG        I

 

GUU        I                              GCU        I                              GAU        I              Asp         GGU        I

GUC        I                              GCC        I                              GAC        I                              GGC        I

                I              Val                          I              Ala                                                                         I              Gly

GUA        I                              GCA        I                              GAA        I              Glu          GGA        I

GUG        I                              GCG        I                              GAG        I                              GGG        I

 

expression du genome

 

transcription et traduction

 

1.et2.Les gènes qui contrôlent la synthèse protéique ne constituent que 10 % de l’ADN. Certains gènes sont transcrits en ARNm, traduits en protéines.

D’autres gènes, transcrits mais jamais traduits en protéines produisent :

- les ARN de transfert (ARNt transporteurs des acides aminés vers les zones de traduction)

- les ARN ribosomiques (ARNr constitutifs des ribosomes).

 

devenir des proteines

 

3.Les protéines néosynthétisées subissent plusieurs modifications postraductionnelles (association avec d’autres molécules, acquisition d’une structure tridimensionnelle…).

 

4.Les protéines modifiées peuvent :

- rester dans le cytoplasme ;

- être incorporées à la membrane plasmique ;

- gagner le milieu extra-cellulaire.

 

5.Certaines protéines assurent un rôle de régulation de la transcription.

 

 

 

schema

 

Gènes transcrits et traduits      Gènes transcrits, non traduits                 ADN non transcrit (90 % de l’ADN total)

ADN

I              ! (1)                                        ! (1)                                                        ! (1)

I              ARNm                                    ARNt                                                      ARNr

I              !                                              !                                                             !

I              ----------(2)             Ribosomeß-----------------------------------------------------

I                                              Protéine  

I                                              ARNm

I                                              !

--------------------------------------- (3)     Protéines

 

PROTEINES CYTOPLASMIQUES        (4)           PROTEINE MEMBRANAIRE                (4)           PROTEINES EXPORTEES

Enzymes,                                                                               Transporteurs,                                        Hormones,

Structure intracellulaire                                          Antigène/anticorps,                                 Anticorps circulants,

Transporteurs…                                                     Récepteurs…                                          Enzymes digestives…

 

les mutations

 

types de mutations

 

Des modifications de la nature ou de la séquence des nucléotides de l’ADN peuvent affecter le génome. Les conséquences de ces mutations génétiques sont très variables, de l’incidence nulle à la mort cellulaire. Les substances mutagènes sont à l’origine de l’évolution biologique (création de nouveaux allèles, de nouveaux gènes…). Parfois elles altèrent la croissance ou la division cellulaire et sont cancérigènes. La cellule dispose de mécanismes de réparation de l’ADN qui assurent la stabilité du génome.

 

les agents mutagenes

 

Les mutations sont des modifications de la séquence de nucléotides de l’ADN. Elles sont spontanées ou induites par des agents mutagènes de type physique ou chimique.

 

les types de mutations

 

Les mutations peuvent être bénéfiques, neutres, délétères ou létales. On parle de mutation ponctuelle quand elle ne concerne qu’un seul nucléotide (cas ci-contre). On distingue 3 types de mutations :

-          Mutations par substitution (1) quand un ou plusieurs nucléotides sont remplacés,

-          Mutation par addition quand un ou plusieurs nucléotides sont insérés,

-          Mutation par délétion (2 et 3) quand un ou plusieurs nucléotides sont éliminés.

Une mutation peut avoir ou non des conséquences au niveau du phénotype.

Une mutation dans un intron ne modifie pas le polypeptide ; les introns étant éliminés avant la traduction de l’ARNm (a).

Une mutation dans un exon peut s’exprimer ou non au niveau du phénotype (b, c, et d).

 

REPARATION DE L’ADN

 

Plusieurs mécanismes permettent d’éliminer une mutation (photoréaction, recombinaison…). Ces réactions complexes permettent l’excision de la partie mutée qui est ensuite remplacée par un segment correctement répliqué.

 

schema

 

AGENTS MUTAGENES

 

PHYSIQUES                           CHIMIQUES

UV, radiations ionisantes…    HNO2, composés alkylants…

 

1.        MUTATIONS PONCTUELLES                             2.et3.       MUTATIONS

PAR SUBSTITUTION                                                           PAR ADDITION OU DELETION

 

                AATCGA                                Séquence de référence            AATCGA                AATCGA

                ACTCGA                Séquence mutée                      ACATCG ATCGAC

 

EFFETS POSSIBLES D’UNE MUTATION PONCTUELLE

 

a. Mutation dans un intron      b. Mutation dans un exon       c. Mutation dans un exon       d. Mutation dans un exon

 

ARNm brin bleu                     ARNm brin en partie orange   ARNm brin en partie orange   ARNm brin en partie rouge

 

POLYPEPTIDE gris                               POLYPEPTIDE gris                               POLYPEPTIDE gris                               POLYPEPTIDE gris

dont 1 orange                         dont 1 rouge

 

Polypeptide                             Polypeptide                             Polypeptide                             Polypeptide

non modifié                            non modifié                            modifié                                   modifié

fonctionnel                             fonctionnel                             fonctionnel                             non fonctionnel

 

---------MUTATIONS SILENCIEUSES---------                     --------------------MUTATIONS FAUX SENS-------------------

 

exemple de phenotype mute

 

les echelles phenotypiques

 

a.        Polypeptide dont la synthèse est contrôlée par les gènes.

(ici synthèse de la bêta-globine, polypeptide qui participe à la construction de l’hémoglobine).

 

b.        Structures et métabolismes cellulaires.

(ici, l’hématie, cellule sanguine qui transporte le dioxygène dans l’organisme).

 

c.        Morphologie, anatomie et physiologie des organes de l’individu.

 

l’albinisme

 

Une mutation du gène contrôlant la synthèse de la tyrosinase peut engendrer l’albinisme.

a.        Phénotype moléculaire : ici l’enzyme est modifiée (un acide aminé est muté) et devient inactive.

L’individu ne produit plus de mélanine.

b.        Phénotype cellulaire : sans granules de mélanine, les mélanocytes ne sont plus pigmentés.

c.        Phénotype macroscopique : la pigmentation globale de la peau, des cheveux et des yeux diminue.

d.        Le phénotype albinos n’apparaît que si la personne est homozygote pour l’allèle récessif (a/a).

Les individus hétérozygotes (A/a) produisent suffisamment de tyrosinase fonctionnelle pour synthétiser la mélanine.

 

schema

 

GENOTYPE                                           Hélice normale        ADN                       Hélice normale       

Chromosome                                                                         Transcription          Mutation

Gène                                                       Hélice normale        ARNm                     Hélice mutée

ADN                                                                                      Traduction

(code génétique)

a.PHENOTYPE                                      Polypeptide gris      !                              Polypeptide gris

MOLECULAIRE                                    dont Thr rouge        Polypeptide             dont Lys orange

Globine bêta                                           Thr                          (enzyme)                 Lys

                                                               Tyrosine à Mélanine                                            Tyrosine à Mélanine non produite

                                                               Action enzymatique

 

b.PHENOTYPE                                      Avec granules         Mélanocytes            Sans granules

CELLULAIRE                                        de mélanine                                            de mélanine

Hématie

 

c.PHENOTYPE                                      Cheveux noirs         Pigmentation           Cheveux décolorés

MACROSCOPIQUE                                               Yeux marron           globale                    Yeux blancs et rouges

                        

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Publié dans PARAMEDICAL

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